黄瓜的根由主根和侧根两部分组成。在土层深厚、土壤结构良好、有机质丰富的条件下，主根入土较深，可达80-100厘米。侧根横向延伸，集中于植株周围30厘米左右范围内，分布在表土以下15-20厘米处。呈圆锥状分布。
黄瓜的主根是由种子发芽 首先伸出的胚根生长发育而成的，称之为幼根，5-6天后幼根发生侧根。幼根生长快慢和发生侧根的多少与土壤温度关系最大，温度高则幼根生长快，发生侧根数多，颜色洁白而鲜嫩，35天左右，根长可达30厘米，根系健壮，地上部分也生长良好；反之地上部分生长弱而缓慢。黄瓜从播种到植株有4-5片真叶展开时定植，为幼苗期，此期根系生长的好坏对以后植株生长发育影响极大，不仅决定着幼苗的壮弱，而且还关系到以后植株的长势和产量高低。
黄瓜易产生不定根，嫁接的黄瓜苗在育苗或定植时，如果栽植偏深而把接口处埋入土壤中，往往因接穗的茎处产生不定根而扎入土壤中，失去嫁接防病的意义。
黄瓜的主根木栓化较早，断根后再生能力较差。因此，不可在秧苗过大时定植，而且要尽可能减轻伤根。
蔓 黄瓜的茎是蔓生性，也称茎蔓。茎的长度因品种类型而异。晚熟品种一般茎蔓长可达3m以上；早熟品种一般茎蔓较短，有的短到1m左右。长蔓品种一般侧枝较多，甚至有第二分枝；短蔓品种一般不发生侧枝。黄瓜的中早熟品种、中熟品种、中晚熟品种、晚 熟品种，一般茎蔓较长，侧枝发生得多；而极早熟品种、早熟品种，一般茎蔓短而没有侧枝或很少侧枝。但茎蔓的长短也与栽培管理条件有关。茎蔓的粗度是判断植株长势的依据。健壮的黄瓜苗，一般茎粗、节间较短，叶片肥大，根系发达。
黄瓜的子叶节以下至地面的茎，叫下胚轴。幼苗期的下胚轴也称幼茎，其高度最好在3厘米以内。如果在育苗过程中幼苗过密、水分过大、温度过高，就会产生幼茎过长而细的现象。黄瓜的主茎节间长度，在5-6节之前节间长度较短；从5-6节以上，愈往上节间愈长。
黄瓜的叶分为子叶和真叶。子叶的大小和厚薄与根系发育程度和幼茎粗细有密切关系。健壮的幼苗，子叶肥大、幼茎粗、根系发达。子叶面积增大期为出土后8-10天。 决定子叶面积大小的因素主要是种子饱满程度、土质营养、温度和水分。
黄瓜的真叶叶片较薄。出苗后8-10天生出第一片真叶，以后随着茎的伸长，在每节产生一片真叶，叶序互生，从第5-6片真叶往上，叶片面积逐片加大。叶片着生在由茎节处伸出的叶柄上，呈掌状五角形，有5条主脉和大量支脉，把根系从土壤中吸收的水分 和无机盐类养分输送到叶片支脉间的细胞中。
叶片对外界环境条件的反应很敏感，因此， 从叶片的表现可判断植株的生长发育状况和症状。
黄瓜的花，基本上是雌雄同株异花，花有三种类型，即雄花、雌花、两性花。雄花有雄蕊5枚，其中4枚两两连生，一枚单生，雄蕊合抱在花柱的周围，花柱侧裂散出花粉。雌花的花柱较短，柱头三裂，下位子房，有蜜腺。两性花是同一朵花中有雌、雄 两种器官。按黄瓜花的性别可分为七种性型的植株：雌雄同株、雌性株、雄性株、雌全同株、雄全同株、雌雄全同株、完全花株。生产上实际应用的是雌雄同株型。棚室栽培的就比露地栽培的雌花数多，雄花数少。生产上可以运用调节光照、温度、营养条件来增加雌花数量，也可以利用乙烯利等激素增加雌花数。通过增加雌花数可增加产量，尤其能增加前期产量。
黄瓜的花着生于叶腋，黄色。开花顺序由下而下；开花节位越低，早熟性越强，这是选择早熟品种的依据。黄瓜开花的时间一般在清晨6时前后，花 的寿命很短，于当日中午前后即可结束。
黄瓜是虫媒花植株，在自然生长状态下， 花粉传播依靠昆虫进行，主要靠蜜蜂传粉。故此，大棚黄瓜必须进行人工授粉。
黄瓜的果实是由子房和花托发育而成的。植物学上称作假浆果，又叫瓠果。因品种不同其果实性状差异很大，长短不一，大的长达60-100厘米，小的只有十几厘米。如宁阳大刺瓜和津研号黄瓜的果实都较大，而东北叶    不同种类黄瓜
儿三、日本地黄瓜、俄罗斯黄瓜等极早 熟地方品种，果实多为短小，果实的表皮多种多样，有无棱、有棱、大棱、小棱和无刺、有刺、大刺、小刺、黑刺、白刺、毛刺、瘤刺、混合刺毛之分；中晚熟品种有刺、大刺、厚皮；而极早熟品种和早熟品种的果实有刺、刺小、刺密、皮薄。薄皮的食用性比厚皮的好，但厚皮的耐运输和耐贮藏。
成熟的果实，表皮变黄，组织变软，已失去了食用价值。食用的商品果实为已长大的幼嫩子房，但表皮尚未老化。此时也正是黄瓜品种特性已充分表现出来的最佳嫩瓜阶段。
黄瓜的种子着生于果实种腔的胎座上，成熟后呈扁平长椭圆形，黄白色。因顶端营养供应具有优势，瓜条中、上部的种子发育早，成熟快。受授 粉和营养条件以及果实发育状况的影响，种子数量差别很大，一条瓜的种子数量一般为100-200粒，多者400粒以上，少的仅数10粒。种子粒数的多少与授粉量有关。种子由种皮、胚、子叶组成，胚是生长中心，子叶是幼苗前期的营养供应中心，因而含有丰富的营养物质。不得不ding。