1.农业在三次产业中的地位
　　改革开放三十年来，新疆三次产业的发展总体水平不断的提高。各产业的产值比重也按着经济发展的规律在变化，新疆农业产值比重总体来讲是符合经济发展进程的，符合工业化进程的规律，即农业比重逐步下降，第二、三产业比重逐步上升。1978年新疆第一产业产值在新疆生产总值中所占的比例是35.8%，2009年为17.8%，下降了18个百分点。三十年来农业在三次产业中的地位不断地变化，比如1980年到1990年之间农业在三次产业中占首要地位，三次产业的顺序是一二三，改革开放刚开始的这个阶段，新疆工业和服务业还没有发达，所以农业对新疆生产总值中的地位高；1991年到1995年和2003年到现在位置的产业结构顺序是二三一，2008年第二产业产值比重达到49.5%；1995年到2003年的产业结构顺序是三二一。新疆产业结构的这种发展形式与新疆九十年代服务业得到快速发展是分不开的，特别是新疆旅游业的发展带动餐饮住宿的发展，对外贸易带动仓储运输的发展为新疆第三产业的发展注入了无限活力。进入二十一世纪后，随着新一轮金融危机的出现新疆的第三产业发展受到影响，产业顺序就变动。
　　2. 农业内部产值结构
　　农业内部各部门在农业总产值的比例不平衡，但各部门历年的产值发展趋势大体上不变。2010年新疆统计数据中我们可以看到，种植业产值在农业总产值中占绝对优势地位，产值超过其他三部门的两倍，其产值历年就在70%左右徘徊，波动幅度不大，这意味着，新疆以种植业为主的地区；林业产值占农业总产值的比重大多年份不足2% ，发展缓慢；标志着农业产业结构升级的畜牧业产值占农业总产值中的比例保持相对稳定，但所占的份额还小。一般经济比较发达，农业结构良好的一些国家畜牧业产值占农业总产值的比重一般超过50%，但是新疆畜牧业历年都徘徊在25%左右，2002年达到28.20%，从此又开始下降，2006年降到21.40%。这不仅远远小于发达国家畜牧业的发展水平，又与有利发展新疆畜牧业的资源环境不对称。渔业产值比重历年基本维持在0.6%-0.8%，是因为新疆是一个水资源严重不足的干旱地区，水资源的分配不合理，主要来源是山雪融化而形成河流，新疆缺乏养渔咸水与场所。
　　3.新疆各地区农业产业结构的现状
　　新疆各地区的经济发展水平极不平衡，各地区农业内部各部门的差异很大。2009年新疆农林牧渔业的总产值最多的地区是伊犁哈萨克自治州，产值为266.793亿元。其次是喀什地区，产值为239.87亿元，农林牧渔业总产值最少的地区是克拉玛依，产值为7.2234亿元；种植业产值最多的地区是伊犁哈萨克自治州，产值为154. 3950亿元。阿克苏地区和喀什地区的种植业产值也超过100亿元以上，产值最少的地区是克拉玛依，产值为2. 3150亿元；林业产值最多的地区是喀什，产值为20. 1745亿元，最少的地区是克孜勒苏柯尔克孜自治州2920万元；伊犁哈萨克自治州的牧业产值最多，产值为101. 3766亿元，昌吉回族自治州占第二位，产值是85. 2977亿元。牧业产值最少的地区是克拉玛依，产值为2. 2653亿元；渔业产值各地区比较少，其中伊犁哈萨克自治州和昌吉回族自治州的产值超过一亿元，其他地区均未过亿元，产值最少的克孜勒苏柯尔克孜自治州的渔业产值仅为188万元。由于新疆各地区的土地面积，自然资源，气候条件和经济发展水平差异较大，所以表现为各地区在种植业，林业，牧业和渔业总体发展水平的差异也很大，这正是新疆各区域差异性的最直接表现。