水源一般都有自我净化功能，这其中的微生物起着很重要的作用。南开大学生命科学学院教授在广州参加一个研讨会时表示，利用微生物重建治污技手术来恢复河道的自净能力，改善河涌的污染效果显著，已经成为各个城市治理水污染的重要方法，然而微生物生态修复技手术不是万能，它所需要的周期比较长，而人类活动的影响远远大于它们的影响，所以它不能完全取代其他办法，关键是还要配合截污和全民的环保意识。
　　第五届中国微生物资源学手术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会上，相关人士肯定了微生物治理污染的作用，此次会议也吸引了中国200多个相关人士和学者参会。
　　由于各个城市现有的污水厂处理能力满足不了现有的需要，因而使用功能性微生物来进行污水处理已经在各个城市开始试点，这项技手术在境外也已成功应用于河道和近海洋面的污染治理。
　　广东省微生物研究所透露，目前广东主要在佛山顺德进行试点，主要是按河涌污染程度、污染指标进行分类，分析出河涌底泥的各种微生物降解能力，再以微生物治污，进行底泥生物氧化，让水体渐渐由黑臭变灰白。
　　微生物除污技手术最关键的是能把污水中的恶臭除掉，毕竟这个技手术能让污染物彻底分解，是很实用的办法。水质检测